http://wwwnc.cdc.gov/eid/article/15/7/pdfs/09-0153.pdf（PDF）
（食品安全情報2009年15号（2009/07/15）収載）
2007〜2008年に日本の幼小児で発生したサポウイルス（SaV） による胃腸炎の調査を行い、SaV株の多様性を分析した。SaVは検便477検体のうち19検体（4%）で検出され、15株（79%）は遺伝子群間（intergenogroup）組換え（GII/GIV）のSaVであった。
検便477検体は、2007年7月〜2008年6月にかけて、日本の5地域（東京、札幌、佐賀、大阪、舞鶴）の小児科医院を受診した急性胃腸炎の外来小児患者から採集した。検体数の地域別内訳は、東京が14、札幌が30、佐賀が77、大阪が91、舞鶴が265であった。下痢の定義は、1日3回以上の無形便（軟便および水様性便）の排泄とした。急性胃腸炎は、下痢症状に加え嘔吐、発熱、腹痛などのその他の症状が認められる場合と定義した。調査対象の小児の年齢は1ヶ月〜14歳（中央値25ヶ月）であった。
下痢検体から分離されたウイルスとしては、A群ロタウイルス（20.5%）が最も多く、続いてノロウイルス（19.3%）、アデノウイルス（4.4%）、SaV（3.9%）、C群ロタウイルス（0.8%）そしてアストロウイルス（0.2%）の順であった。また検体の1.8%にウイルスの混合感染が認められた。
SaVは19検体（4%）で検出された。SaV患者が最も多かったのは1歳児グループで（9人、47%）、患者の大部分（13人、68%）は3歳未満であった。SaV患者数は12月から2月にかけてわずかに増加した（12人）。SaV 小児患者で多く認められた症状は、下痢（19人、100%）、38℃以上の発熱（5人、26%）および1日3回以上の嘔吐（3人、15%）であった。
19株のSaVのゲノム部分塩基配列を決定し、最近提唱されたキャプシド遺伝子領域の配列にもとづくSaV分類法によりグループ分けした。その結果、大多数（15株、79%）が遺伝子群（G）IVに属し、ついでGI/4（3株、16%）およびGI/1（1株、5%）であった。GI/4の3株は、相互のヌクレオチド配列同一性が98〜100%であり、GI/4に属すことが知られているKarachi/872/91/PK株およびOsaka/5836/JP株と同じグループに分類された。GI/1の1株はManchester株とヌクレオチド配列同一性が97%であり、これにより同群に分類した。
GIVに分類された15株は、検出された場所が互いに地理的に遠く離れているにもかかわらず、それらのヌクレオチド配列にほとんど相異が認められなかった（98〜100%の同一性）。従って、15株は同一の株（ここでは8208/Maizuru/08/JP株とする）と考えられた。8208/Maizuru/08/JP株のヌクレオチド配列は、Ehime1107株およびSW278株と97%の同一性を、またYak2株と96%の同一性をそれぞれ示した。これら3株は、GII由来のポリメラーゼ領域とGIV由来のキャプシド領域を持つ遺伝子群間組み換えSaVとして知られている。
本調査で検出されたGIV株は遺伝子群間組換えウイルスであると考えられる。この株は相互に遠隔の4地域で検出されており（舞鶴10例、札幌2例、佐賀2例、大阪1例）、日本全国に広く分布していることが示された。